II. Bayezid'in çok sayıda çocuğu olmuştur. Osmanlı İmparatorluğu'nda şehzadelerin çok sayıda olması ve taht kavgalarını önlemek amacıyla çeşitli stratejiler uygulanmıştır.
Bilinen en önemli oğulları ve kızları şunlardır:
Bu şehzadeler arasında taht kavgaları yaşanmış ve sonunda Yavuz Sultan Selim, babasını tahttan indirerek Osmanlı padişahı olmuştur. Bu durum, Osmanlı tarihinde sıkça görülen https://www.nedemek.page/kavramlar/taht%20kavgası geleneğinin bir örneğidir.